Về truyền thuyết hình thành tháp Bà Po Nagar xuất hiện nhiều dị bản nhưng nổi tiếng nhất là câu chuyện về một vị nữ thần có tên gọi là Po Nagar, mà người Việt thường gọi là Thiên Y Thánh Mẫu Ana, được sinh ra từ mây và biển. Bà là người đã tạo ra mùa màng, cây cối, lúa gạo, dạy người dân cách cày cấy, dệt sợi nên rất được yêu mến và tôn trọng. Sau khi bà về trời, họ lập ra tháp Bà để thờ phụng, thể hiện lòng biết ơn. Mỗi năm, vào ngày 23/3 âm lịch đều tổ chức lễ dâng hoa.