Phnom Penh nằm ở khu vực khí hậu nhiệt đới gió mùa, với hai mùa rõ rệt là mùa khô và mùa mưa. Mùa khô của Phnom Penh kéo dài từ tháng 12 năm trước tới tháng 5 năm sau. Trong mùa khô lại có 2 tiểu mùa gồm tiểu mùa mát từ tháng 12 tới tháng 2, tiểu mùa nóng từ tháng 3 tới tháng 5. Thời tiết mùa khô nhìn chung đều khô ráo, thuận tiện cho việc di chuyển. Hoàn hảo nhất là bạn du lịch vào tiểu mùa mát, tha hồ vi vu đây đó mà chẳng ngại nắng gắt.
