Tránh tiếp xúc với mắt và miệng, tránh bôi lên vết thương hoặc vết bỏng diện rộng. Nếu gặp các phản ứng quá mẫn hoặc kích ứng nặng tại chỗ khi dùng thuốc cần ngừng thuốc, lau sạch thuốc và điều trị bằng kháng sinh thay thế. Nếu người bệnh bị tiêu chảy năng hoặc kéo dài do đau quặn bụng thì nên ngưng thuốc và đi khám để phòng ngừa viêm ruột kết màng giả dù ít khi xảy ra khi dùng mupirocin tại chỗ. Trẻ em bị bệnh chốc ghẻ: Vết thương hở nên được băng lại cẩn thận để hạn chế tiếp xúc với nước khi trẻ đến trường.
Phụ nữ có thai: An toàn, tỉ lệ hấp thu thuốc toàn thân từ dạng bôi tại chỗ rất thấp.
Phụ nữ cho con bú: Sử dụng thận trọng, nếu phải bôi thuốc để điều trị nứt núm vú thì nên rửa sạch núm vú trước khi cho con bú.
Cần hiệu chỉnh liều trên người bệnh suy thận: Do chế phẩm có chứa polyethylene glycol nên không sử dụng trong trường hợp người bệnh có thể hấp thu lượng lớn polyethylene glycol, nhất là khi có bằng chứng suy thận vừa hoặc nặng.